apres avoir eut le meme type de soucis voila ce que j ai fais:
1: aller dans Var/Lib/Apt/Lists , tout supprimer sauf le dossier partile....RIEN meme probleme
2 : réinstaller Cydia via le terminal....... Rien , meme problème
mais en tout supprimant dans : var/lib/dpkg/updates et en rebootant , miracle Cydia est reparti.
Mais plus rien du tout dans les fichiers installés et meme plus le "This device has an SHshS on file....."

lors du deuxieme lancement apres cette manip il y avait un update de Cydia de proposé ,que j ai fait et tout est revenu a la normal
si ca peut servir a quelqu un
